氨基酸的保守性
【清华大学生命学院郗乔然课题组揭示TGF-β信号通路调控小鼠胚胎干细胞中内胚层分化的新机制】7月9日,清华大学生命科学学院郗乔然副教授课题组在《自然·通讯》期刊在线发表题为“一条受Nodal信号通路诱导的微肽NEMEP在干细胞向中内胚层分化过程中调控葡萄糖吸收”的研究论文。在该研究中,通过生物信息学的手段在全基因组范围内鉴定到一系列TGF-β信号通路调控的LncRNAs,并选取了一条未被报道过的“LncRNA—Gm11549”进行了深入的研究。研究发现,Gm11549实际上可以翻译成为一条长度为63个氨基酸、物种间高度保守并且定位于细胞膜的单次跨膜微肽。研究团队还基于生物化学、遗传学、细胞生物学及代谢组学等分析实验,阐明了NEMEP通过与葡萄糖转运蛋白GLUT1和GLUT3的结合以促进葡萄糖的吸收过程。
#科研速递#
AlphaFold 2不再一家独大!DeepMind和华盛顿大学团队同日抢发Nature和Science
去年年底,谷歌 AI 团队 DeepMind 的第二代 AlphaFold 算法在生物界引起了极大的轰动,它能准确地预测蛋白质的结构,以至于许多人宣布这个长达数十年的问题“已被解决”。

具体而言,AlphaFold2 在国际蛋白质结构预测竞赛(CASP)上精确地基于氨基酸序列预测蛋白质的3D结构。其准确性可以与使用冷冻电子显微镜(CryoEM)、核磁共振或 X 射线晶体学等实验技术解析的3D结构相媲美。
当时此消息一出,立刻登上了Nature杂志封面,标题直接评论为:“它将改变一切!”李飞飞、马斯克等众多大佬纷纷点赞、转发。
而就在今日,在最新一期的《 Science 》杂志上,有来自西雅图华盛顿大学医学院蛋白质设计研究所的研究团队,公布了其人工智能系统RoseTTAFold的研究结果,它在预测蛋白质3D结构方面的表现,与AlphaFold2的水平几乎相当,而且速度更快、所需计算机处理能力更低,更令人惊喜的是,RoseTTAFold 直接免费开源!

论文链接:https://science.sciencemag.org/content/early/2021/07/14/science.abj8754
同日, DeepMind 的 CEO 哈萨比斯等人在 《Nature 》上也发表论文,公布了 AlphaFold2 的源代码,并且详细描述了它的设计框架和训练方法。
有趣的是,为了和 Science 同一天抢发论文,Nature 特意在论文标题前开头备注:“这是一份未经编辑的手稿,但是已允许出版。Nature Research 乐意为作者和读者提供这份手稿的早期版本。”

论文链接:https://www.nature.com/articles/s41586-021-03819-2_reference.pdf
RoseTTAFold——后来居上
AlphaFold2——姗姗来迟的揭秘
参考资料:
https://science.sciencemag.org/content/early/2021/07/14/science.abj8754
https://science.sciencemag.org/content/373/6552/262
https://www.nature.com/articles/s41586-021-03819-2
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AlphaFold 2不再一家独大!DeepMind和华盛顿大学团队同日抢发Nature和Science
什么是脑动脉硬化性精神病
因脑动脉硬化影响大脑血液供应,并伴有反复脑血管意外发作(包括多发性梗塞或出血)所致的痴呆是老年期最常见的精神疾患。在国外本病发病率颇高,估计约占精神病住院病人的10%,国内发病低,占1%。据美国《中风》杂志报道,腔隙性梗塞病人痴呆发病率高于正常人群4—12倍;另一研究表明平均65岁以上不同程度缺血病灶的患者中多发梗塞病人痴呆发生率为47.6%,这是因为梗塞后局部脑细胞损害很难恢复,进而影响脑功能而引起痴呆。
脑动脉硬化性痴呆的病因:脑动脉硬化致使脑动脉壁逐渐增厚,管腔狭窄,管壁弹性降低,脑血液循环阻力增高,造成脑组织的缺血、缺氧、梗塞、出血和软化灶,最后形成疤痕、腔隙和脑组织弥漫性萎缩,导致脑功能进行性衰退。
脑动脉硬化性痴呆的诊断:
一、常伴有高血压、高血脂和躯体部分动脉硬化症状。
二、有反复的卒中和短暂脑缺血性发作史。
三、近记忆障碍为主要表现,人格在较长时期内保持完整。
四.病程常明显波动性。
五、常伴有脑局灶性损害体征。包括动作不稳、肢体末梢震颤、麻木、瞳孔缩小,对光反应迟钝。有脑血管意外的病人也可遗留偏瘫、单瘫、失语、失用、假性球麻痹等。
六、脑电图显示a节律减馒,有时成为О频率,特别是在额区、颞区或枕区。
七、头颅CT,MRI可了解多发性梗塞、脑出血等。动脉硬化性痴呆的治疗:
一、首先治疗高血压和动脉硬化,要把血压控制在正常范围内,但不宜降压过低,以免促进梗塞。
二、应用脑微循环药物:如维脑路通、丹参、脑益嗪及扩管药,尼莫地平、心脑舒通。
三、小剂量阿司匹林50–300mg每日一次,对降低血液高凝状态,预防梗塞有效。
四、目前应用脑活素治疗脑血管性痴呆疗效良好,因脑活素是一种无蛋白质的标准化器官特异性氨基酸和低分子肽组成的化合物,可通过血脑屏障,直接向脑神经细胞提供肽类等营养物质,可增强腺苷酸环化酶及胆碱酯酶的活性,并能作用于蛋白质合成影响其呼吸链,增加脑内毛细血管密度,从而纠正脑缺血缺氧,增加能量的供给,促进脑细胞的功能恢复,改善脑功能。
五、其它。对烦燥及兴奋者可口服安定;抑郁症明显者口服氦酯醒;高压氧治疗对某些早期患者可有一定疗效。
脑血管性痴呆的预防:在日常生活中,肥胖者应适当控制总热量摄入减轻体重;把血胆固醇控制在正常范围;限制食物中钠摄入量,多吃新鲜蔬菜、水果和粗粮;戒烟,少饮酒;适度体育锻炼;保持心情愉快。
肩周炎
肩周炎是以长期肩部痛疼,肩关节活动障碍为特征的病症,好发于50岁左右的女性。肩周炎的主要症状是疼痛逐渐加重,部位在肩关节前方及后方相当于关节囊的部位,有时放射到上臂及肩胛部。夜间加重,甚至痛醒或彻夜不眠。肩关节活动时痛疼加剧。另一重要症状为肩关节各方向活动受限,以外展,外旋,后伸运动障碍最显著。如不能梳头、穿衣服、洗脸等。病程较长者,由于肩部长期处于少动状态,造成肩部肌肉萎缩,尤以三角肌萎缩明显,X线检查无帮助,可排除骨与关节疾病,诊断本病需排除颈椎病所致肩臂放射痛。后者肩臂部往往无明显压痛点,肩关节活动无障碍。
本病主要是保守治疗。严重疼痛时应该制动,用三角巾悬吊上肢,使肩关节休息。可进行局部激素封闭。理疗可改变局部血液循环,消除粘连,减少腱鞘增厚。另外红外线、超短波,蜡疗都有一定疗效经过制动疼痛开始运动功能锻炼是治疗肩周炎的重要手段。只有进行适当的活动,才能使肩部血液循环加重,营养供应改善,增强肌肉和韧带的柔韧性,预防肌肉萎缩,使粘连分离。增加肩关节活动幅度,锻炼方法较多。如爬墙运动:面对或侧对墙壁,举臂摸墙,使高度逐渐上升,每日3—5 次,每次5—10分钟,手拉滑车:可在屋柱上装一滑车悬挂绳索、–端系着患肢,以健侧上肢牵拉另一端绳子,上下牵拉来帮助患侧肩关节的锻炼活动。甩手:患者站立,两足分开与肩宽,两臂轻轻前后,左右摆动。药物治疗包括口服消炎止痛药,如布洛芬,芬必得,中药服用补气血、益肝肾、温经络﹐祛风湿之类药,如大活络丹,独活寄生丸,外用药如麝香止痛膏,红花油。也可配合针灸按摩。