N-端氨基酸
学习打卡第一天:
医学生集合了[大笑]
生物化学与分子生物学:蛋白质主要由碳、氢、氧、氮、硫组成,有些蛋白质还含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别还含有碘。各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。
氨基酸根据其侧链的结构和理化性质可分为五类:非极性脂肪族氨基酸、极性中性氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸。非极性脂肪族氨基酸:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、甲硫氨酸;极性中性氨基酸:丝氨酸、半胱氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、苏氨酸;含芳香环的氨基酸:苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸;酸性氨基酸:天门冬氨酸、谷氨酸、;碱性氨基酸;精氨酸、赖氨酸、组氨酸。
在某一PH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的PH称为该氨基酸的等电点。
含共轭双键的氨基酸具有紫外线吸收性质。
茚三酮反应是指茚三酮水合物在弱酸性溶液中与氨基酸共加热时,氨基酸被氧化脱氨、脱羧,而茚三酮水合物被还原,其还原物可与氨基酸加热分解产生的氨结合,再与另一份子茚三酮缩合成为蓝紫色化合物,此化合物最大吸收峰在570nm波长处。由于此吸收峰值的大小与氨基酸释放出来的氨量成正比,因此可作为氨基酸定量分析方法。
由2-20个氨基酸相连成的肽成为寡肽,而更多的氨基酸相连成的肽称为多肽。多肽链有两端,其游离a-氨基的一端称为氨基末端或N-端,游离a-羧基的一端称为羧基末端或C-端。肽链中的氨基酸分子因脱水缩合而基团不全,成为氨基酸残基。[奋斗][奋斗]
生物化学蛋白质的分子结构PPT
蛋白质分子结构分为一级、二级、三级和四级结构,后三者称为高级结构和空间结构,并非所有蛋白质都有四级结构,由一条肽链组成的蛋白质只有一、二、三级结构,由两条或两条以上多肽链组成的蛋白质才可能有四级结构。
(1)一级结构:在蛋白质分子中,从N-端到C-端的氨基酸排列顺序称为蛋白质的一级结构,一级结构中的主要化学键是肽键,此外,有些蛋白质分子尚含有二硫键,由两个半胱氨酸羧基脱氢氧化而生成,一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。
(2)二级结构:蛋白质的二级结构是指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间构象,也就是该肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。二级结构的主要形式,包括α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲等。
(3)三级结构:蛋白质的三级结构是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条肽链所有原子的三维空间的排布位置。
(4)四级结构:许多蛋白质在两条或两条以上的多肽链,肽链与肽链之间并不是通过共价相连,而是由非共价键维系,每一条多肽链都有自己完整的一级、二级和三级结构,称为亚基,亚基与亚基之间特定的三维空间排布和相互作用,称为蛋白质的四级结构。
生物化学——蛋白质的分子结构,生物化学蛋白质的分子结构PPT
【葡萄白腐病菌糖苷水解酶74家族木葡聚糖酶基因CvGH74A编码一个新的致病力因子】白腐病是葡萄上一种毁灭性的真菌病害,在世界范围内广泛分布。青岛农业大学周善跃研究团队近年来的研究发现,白腐病菌是引起中国葡萄白腐病的主要病原菌。葡萄枝蔓受病原菌侵染后,其周皮被严重降解,由此我们推断细胞壁降解酶可能在葡萄白腐病菌侵染致病过程中发挥重要作用。通过体外和体内细胞壁降解酶活性检测,病原菌均表现出很高的木聚糖酶和木葡聚糖酶活性,并且强致病力菌株的木聚糖酶和木葡聚糖酶活性都显著高于弱致病力菌株,由此我们推断木聚糖酶和木葡聚糖酶可能是该病原菌的重要致病因子,并且病原菌的致病力与两类细胞壁降解酶的水解活性正相关。对病原菌的基因组分析发现,该病原菌含有两个糖苷水解酶74家族木葡聚糖酶基因,分别命名为CvGH74A 和 CvGH74B。氨基酸序列分析显示CvGH74A第1-27个氨基酸为信号肽,蛋白三维结构预测结果显示CvGH74A的N-端和C-端分别含有一个该家族水解酶特有的seven-bladed β-propellers结构。为了鉴定CvGH74A基因在病原菌致病中的作用,我们首先利用qRT-PCR技术检测了CvGH74A基因的时序表达,结果显示在病原菌侵染过程中CvGH74A基因高水平表达。我们进一步利用split-marker的方法和PEG介导的真菌遗传转化技术构建了CvGH74A基因的缺失突变体。对CvGH74A基因缺失突变体的表型检测结果表明,CvGH74A基因的缺失未能引起病原菌菌丝生长、菌落形态和分生孢子的变化。对葡萄叶片接种结果显示,CvGH74A基因缺失突变体的致病力显著降低,而回补体菌株的致病力恢复到野生型水平,说明CvGH74A基因在病原菌的致病中具有重要作用。酶活性检测结果显示CvGH74A基因突变体木聚糖酶和木葡聚糖酶的水解活性均显著减弱,而回补体菌株的酶活性均恢复到野生型水平,说明CvGH74A同时具有木聚糖酶和木葡聚糖酶的水解活性,且其酶活性可能对病原菌的致病力具有调控作用。本研究首次明确了细胞壁降解酶在葡萄白腐病菌侵染致病中的作用,鉴定了木葡聚糖酶CvGH74A基因编码一个重要的致病因子,为全面解析该病原菌的侵染致病机制奠定了基础。文章已在JIA2020-11期刊出,全文链接
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