氨基酸残基的邻居
新冠病毒是人造的吗?
大自然不会自己进化出连续四个带正电荷的氨基酸的蛋白质吗?
挪威病毒学家 Birger s ? rensen 和英国一位研究肿瘤和艾滋病的院士Angus Dalgleish声称他们早就发现了新冠病毒是人造的证据,但是他们的学术成果一直被打压没有被任何正式的学术刊物认可。现在,随着美国为首的国家再次渲染新冠病毒实验室泄漏论,这两位科学家又开始活跃起来,并大肆宣扬自己的研究成果被科学界迫害不能发表。
许多新闻报道了这件事,但却没有任何实质性的内容,我找了好半天,终于在一个报道中找到一点干货。英国这位院士在接受《每日邮报》采访时声称,他们之所以认为新冠病毒是人造的,原因之一是“大自然不允许四个带正电荷的氨基酸连续出现”(The laws of physics say that you can not have four positively charged amino acids in a row.)。
主要的带正电荷的氨基酸是碱性氨基酸,一共有三种(某些氨基酸在特定条件下也可能带正电),它们是精氨酸、组氨酸和赖氨酸,它们的单字母缩写符号是R、H、K。连续四个氨基酸的话,一共有81种可能的排列。
现在,让我们打开NCBI( 美国国家生物技术信息中心)的BLAST*页面,选择蛋白质BLAST,并选择swissprot蛋白质序列数据库。我随手输入了RRRR,马上跳出了一大堆含有连续出现四个RRRR带正电荷氨基酸的蛋白质,包括很多物种,我选了一个人类(Homo??sapiens)的例子(图四)。看来这位英国院士已经找到了人类不是进化而来的,而是由上帝或者外星人制造的证据了。因为,The laws of physics say that you can not have four positively charged amino acids in a row.
而且更奇怪的是,根据发表在uniprot网站——学术界非常知名的高质量且免费的蛋白质序列与功能信息数据库——中新冠病毒spike蛋白(帮助病毒进入细胞的蛋白),也是这两位科学家重点研究的蛋白的序列(图五)中,我竟然没有找到连续四个带正电荷的氨基酸残基!连续四个RHK的任意组合,我一个都没有找到,RKR已经是我能找到的连续带正电荷的序列了,也只有三个,哪来的四个?
*BLAST全称Basic Local Alignment Search Tool,即“基于局部比对算法的搜索工具”,是生物信息学常用算法,可将输入的核酸或蛋白质序列与数据库中的已知序列进行比对,获得序列相似度等信息,从而判断序列的来源或进化关系。#新冠肺炎#
溶菌酶对细菌细胞壁的作用机制
科技日报合肥3月24日电 (记者吴长锋)记者从中国科学技术大学获悉,该校微尺度物质科学国家研究中心和生命科学学院陈宇星教授、周丛照教授和孙林峰教授课题组合作,阐明了金黄色葡萄球菌胞壁酸翻转酶转运胞壁酸的机制和翻转酶特异性抑制剂的抑制机制。该研究成果日前在线发表在微生物领域专业杂志《分子生物技术》上。
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)是主要的临床致病菌之一,其引发的感染难以治愈甚至可能致死。由于近年来抗生素滥用,出现了对所有的β-内酰胺类药物都具有抗性的MRSA菌株。研究表明金黄色葡萄球菌细胞壁主要成分胞壁酸是引起耐药性的关键因素之一。在革兰氏阳性菌中,胞壁酸是一类共价连接在肽聚糖上的阴离子多聚物。胞壁酸在细菌分裂、生物膜形成、宿主定殖以及细菌感染等过程中起着重要作用。因此,胞壁酸合成路径中的关键酶是新型抗菌药物的重要靶点。作为最具潜力的抗生素靶标之一, 翻转酶及其抑制剂得到广泛研究。先导化合物小分子特异性抑制剂,是近期被鉴定出来特异性抑制效率较高的抑制剂,但是其抑制的分子机制并不清楚。
科研人员用冷冻电镜方法,解析了金黄色葡萄球菌胞壁酸翻转酶的同源蛋白,基于结构,研究人员计算出了底物转运通道,通过对组成通道的氨基酸残基性质分析并结合生理实验,阐明了底物特异性识别机制。通过结构比对研究提出翻转酶及其同源蛋白利用“曲柄连杆”原理来实现底物转运的分子机制。具有类似结构特点的ABC转运蛋白都可以利用这一机制通过相对微小的总体构象变化转运较大的底物。
该研究进一步通过生化实验和计算机模拟确定了特异性抑制剂结合翻转酶的精确位点,并阐明了其抑制翻转酶转运胞壁酸的分子机制。研究结果将为设计和优化针对MRSA的新型抗生素提供结构基础和理论指导。
我学者解析致病菌胞壁酸翻转酶功能机制,溶菌酶对细菌细胞壁的作用机制
世界上最长的“单词”:共有189819个字母,翻译汉字却只有4个字
根据维基百科里记录,世界上最长的英文单词由189819个字母组成,这如果被老师用来罚抄学生,估计这学生想死的心都有了[黑线][黑线][黑线],这单词是应用在化学中,在百度百科里算是非正式承认版本,翻译成中文就是“肌联蛋白”[捂脸],主要这个词在形式上是按顺序将蛋白的所有氨基酸残基的英文名排列在一起,但是它是IUPAC名(在化学上称为系统命名),由国际纯粹与应用化学会(IUPAC)的规则命名,事实上就是一个英文单词,是标准意义上的化合物名,所以才这么长。
百度百科里正式承认版本的世界上最长单词是:pneumonoultramicroscopicsilicovolcanoconiosis,[医]肺尘病,矽肺病(共有45个英文字母)。