保守氨基酸 保守氨基酸残基的重要性

如何预测蛋白氨基酸突变的保守性

如何预测蛋白氨基酸突变的保守性

蛋白质的结构和功能是由某些关键的氨基酸决定的，当这些氨基酸改变时，则蛋白质也发生相应的变化，而当一些意义的不大的氨基酸被其他氨基酸取代时，蛋白质不一定能发生结构功能的改变。 比如血红蛋白C(HbC)，β链中赖氨酸被谷氨酸取代，但是依旧,将两条氨基酸的序列的各种性质做一个比较，比如疏水性呀，等电点呀，看看有没有明显的变化；另外将不同物种同源序列做个聚类，看看该突变的位点是否处于很保守的位置，如果是的话，该突变可能对结构和功能有较大的影响。

甘氨酸Gly，脯氨酸Pro，这两种氨基酸也很保守是因为有什么特点

参与体内蛋白质合成的20种氨基酸,根据其侧链的结构和理化性质可以分为以下4类.

非极性R基团氨基酸：该组氨基酸的R侧链基团为非极性的疏水基团.包括：甘氨酸Gly,丙氨酸Ala,缬氨酸Val,亮氨酸Leu,异亮氨酸Ile,脯氨酸Pro,苯丙氨酸Phe.

2.不解离的极性R基团氨基酸：该组氨基酸的R侧链基团在中性溶液中不发生解离,但含极性基团,可与水分子形成氢键.包括：色氨酸Trp,丝氨酸Ser,酪氨酸Tyr,半胱氨酸Cys,蛋氨酸Met,天冬酰胺Asn,谷氨酰胺Gln,苏氨酸Thr.

3.可发生负电解离R基团氨基酸：该组的氨基酸R侧链基团在中性溶液中解离,生成带负电荷的氨基酸.包括天冬氨酸Asp,谷氨酸Glu；通常也将这二个氨基酸称为酸性氨基酸.

4.可发生正电解离R基团氨基酸：该组氨基酸的R侧链基团在中性溶液中可解离,生成带正电荷的氨基酸.包括：组氨酸His,赖氨酸Lys,精氨酸Arg； 通常也将这三个氨基酸称为碱性氨基酸.

什么是保守氨基酸

就是指不同，但具有一定进化关系的蛋白质的氨基酸序列中相同的氨基酸序列中的氨基酸残基，就叫做保守氨基酸残基。

有没有什么基因是动物、植物、微生物共有的？

现存地球上的微生物，动物和植物都是经过几十亿年的进化形成的，但是进化并不意味着所有的部分都是平等的。就像20世纪20年代、50年代和今天的车，在外形甚至功能很多方面，它们是截然不同的。但核心几乎都是在内燃机上运行的。有些基因就像内燃机，很难对它们进行太大的修补和改进，否则整个生物个体就无法生存。

一旦进化找到了有用的部分，它就倾向于继续重用它。

所有生物都有许多相似的生物过程需要做：

DNA

复制，细胞分裂，蛋白质合成，生物大分子分解，分子复合体折叠组装，细胞骨架支撑起细胞。这并不意味着参与这些过程的蛋白或者编码这些蛋白的基因不能改变；只是他们的变化可能是有限的。例如，利用葡萄糖的一系列反应从糖酵解的步骤开始。地球上几乎所有的生物都有相同的酶己糖激酶催化相同的反应步骤，如果你比较这些蛋白质构象发现它们看起来几乎都是一样的。

一旦进化找到了有用的部分，它就倾向于继续重用它。

DNA

作为真核生物，在微生物，动物和植物之间有大量的共享的基本代谢和细胞生物学，虽然具体到DNA水平上，你通常会发现很多不同之处，这有两个原因造成，第一是氨基酸密码子编码序列有简并性——香蕉和人类可能在一个蛋白质位置都是亮氨酸，但是一个编码TTG和另一个CTC。另外一个原因是有许多蛋白质只要保守结构域的构象相同，就能执行相同的功能，因此存在进化中的保守氨基酸，这些保守氨基酸构成了该蛋白质功能的核心结构域。

如酵母与人，尽管酵母由单个细胞组成，人类有数万亿细胞组成复杂的系统，但我们有成千上万个相似的基因。其中，大约有450个基因对酵母的生存至关重要，2015年5月份发表在science文章中研究人员将酵母菌的基因移除，并将其替换为人类相对应的基因，观察酵母菌是否能生存。创造了数百种新的酵母菌株，每一个都带有一个人类基因，结果显示，几乎有一半的新菌株在人类基因交换替代酵母基因后能够存活和繁殖。两个物种基因能否成功替换的最佳预测因素不是它们的基因序列有多相似，而是它们属于哪个模块。

什么是保守氨基酸传感域?

“传感域”这个词很新鲜啊，没见过，不过我推测您这是从英文翻译过来的吧，还是domain一类的单词，如果是domain倒是听过，说是结构域，如果结构域的话你上网一搜就很容易明白什么意思了。希望对你有帮助！