氨基酸上突变分布
Peutz-Jeghers 综合征(PJS)。
在中国人群中发病率较低,约为 1/1,300,000。本病为常染色体显性遗传,遗传学研究已经证实,位于人类 19 号染色体上的 LKB1 基因的突变是导致 PJS 发生的主要因素。
基因的缺失及不同类型突变均能使 LKB1 氨基酸改变或产生截短蛋白,进而引起 PJS 患者胃肠道出现良性错构瘤性息肉,最终可演变为恶性肿瘤。
此外,LKB1 基因发生截短突变将会使得 PJS 患者更早出现相关临床症状,如黑斑以及其他消化道并发症。临床特点
皮肤黏膜黑斑为本病特征性临床表现之一,主要发生在口唇周围、口腔黏膜及四肢末端,也可累及舌、眼周、脐周及鼻周。
约 90% 患者于婴儿或儿童期出现,偶在成人后发生,可随年龄增长而逐渐增多,部分患者中年以后黑斑颜色可自行消退。
黑斑多为圆形或椭圆形,界限清楚,数目不一,散在分布,或部分融合,组织病理表现为基底层黑素细胞、黑素小体增多,真皮浅层嗜色素细胞浸润。
消化道息肉临床症状主要为腹痛、腹泻及便血等,息肉大而多者容易发生肠梗阻、肠套叠和肠坏死,部分患者无明显症状。
息肉可发生于整个胃肠道,以小肠(64% )为主,其次为结肠(53% )、胃(49% )和直肠(32% )。数目可为数枚至上百枚,大小不一,可为米粒大至数厘米,小者基底宽而无蒂,大者呈分叶状有蒂,表面光滑。小部分患者仅有消化道息肉,无皮肤黏膜黑斑表现。\n\n其组织病理类型以错构瘤为主,镜下可见黏膜平滑肌呈树枝状伸入腺管之间,腺上皮分化正常。本病具有癌变倾向,患者终生罹患恶性肿瘤的风险明显增高,其中结肠癌为 39% ,胃癌为 29%
研究称奥密克戎或带有感冒病毒基因 科学家盼“弱病毒”扭转疫情
尽管针对新冠变异株“奥密克戎”仍有诸多未解谜团,但通过基因序列的分析,研究人员发现,“奥密克戎”变异株可能由新冠病毒与另一种导致普通感冒的病毒基因片段组合进化而来。 来自美国马萨诸塞州剑桥数据分析公司nference的一项早期研究显示,患者肺部和胃肠系统中的细胞可以同时携带新冠病毒和普通感冒冠状病毒,这种共同感染为病毒重组创造了条件。这项最新的研究发现12月3日首次发表在OSF Preprints网站上。
研究者写道,“奥密克戎”病毒刺突蛋白上有26个氨基酸突变,包括23个替换、两个缺失和一个插入,其中一个插入突变ins214EPE在此前任何的新冠变异株当中都没有观察到。但该突变基因序列在导致普通感冒的病毒(例如HCoV-229E)中非常常见,也存在于人类基因组中。 负责这项研究的nference公司研究员Venky Soundararajan表示,相同的基因序列多次出现在一种导致人类普通感冒的HCoV-229E冠状病毒和导致艾滋病人免疫缺陷的病毒中。(第一财经,希隆)

来源: 每日经济新闻
研究称奥密克戎或带有感冒病毒基因 科学家盼“弱病毒”扭转疫情
生物学家劳伦斯·赫斯特和斯蒂芬·弗里兰在20世纪90年代末把天然基因密码和计算机随机产生的几百万组密码拿去比对,结果轰动一时。他们想知道,如果发生点突变这种把一个字母换掉的变异,哪一套密码系统能保留最多正确的氨基酸,或将它代换成另一个性质相似的氨基酸。
结果他们发现,天然的基因密码最经得起突变的考验。点突变常常不会影响氨基酸序列,而如果突变真的改变了氨基酸,也会由另一个物理特性相似的氨基酸来取代。据此,赫斯特与弗里兰宣称,天然的遗传密码比成千上万套随机产生的密码要优良得多。它不但不是大自然密码学家愚蠢而盲目的作品,而是万里挑一的密码系统。
天然的三联基因密码的第一个字母都有特定的对应方式。举例来说,所有以丙酮酸为前体合成的氨基酸,它们密码的第一个字母都是T。所有由α-酮戊二酸所合成的氨基酸,其三联密码第一个字母都是C;所有由草酰乙酸合成的氨基酸,第一个字母都是A;最后,几种简单前体通过单一步骤所合成的氨基酸,第一个字母都是G。
三联密码的第二个字母和氨基酸是否容易溶于水有关,或者说和氨基酸的疏水性有关。亲水性氨基酸会溶于水,疏水性氨基酸不会溶于水,但会溶在脂肪或油里,比如溶在含有脂质的细胞膜里。所有的氨基酸,可以从“非常疏水”到“非常亲水”排列成一张图谱,而正是这张图谱决定了氨基酸与第二个密码字母之间的关系。疏水性最强的六个氨基酸里有五个,第二个字母都是T,所有亲水性最强的氨基酸第二个字母都是A。介于中间的有些是G有些是C。
三联密码的第三个字母不含任何信息,不管接上哪一个字母都没关系,这组密码子都会翻译出一样的氨基酸。以甘氨酸为例,它的密码子是GGG,但是最后一个G可以代换成T、A或C。
第三个字母的随机性暗示了一些有趣的事情。二联密码可以编码16种氨基酸。如果我们从20个氨基酸里拿掉5个结构最复杂的(剩下15个氨基酸,再加上一个终止密码子)这样前两个字母与这15个氨基酸特性之间的关联就更明显了。因此,最原始的密码可能只是二联密码,后来才靠“密码子捕捉”的方式成为三联密码,也就是各氨基酸彼此竞争第三个字母。
第一个字母和氨基酸前体之间的关系直截了当,第二个字母和氨基酸的疏水性相关,第三个字母可以随机选择。这套密码系统除了可以忍受突变,还可以降低灾难发生时造成的损失,同时可以加快进化的脚步。因为如果突变不是灾难性的,那应该会带来更多的好处。