茶叶的风味与品质很大程度归因于多酚，生物碱和氨基酸的存在。特别是每种自由氨基酸（酰胺）有自己的风味，或甜或苦或酸，这也是为什么说自由氨基酸是绿茶风味的主要贡献者。
在茶叶中，总游离氨基酸的范围一般在1％~5％，多酚类化合物的范围一般在20%~40%。在品质优良的绿茶中，一般具有较低的酚氨比，使得茶汤的收敛性和醇厚感恰到好处。在茶树中发现的最丰富的游离氨基酸是茶氨酸（Thea），谷氨酰胺（Gln），谷氨酸（Glu）和精氨酸（Arg）。其中茶氨酸是茶叶中独有的，并具有许多益处。另外，茶树中氨基酸的实际含量受植物品种和营养以及当地环境的影响很大。
黄金芽，是比较出名的一种黄化茶叶。幼嫩的可供制作的茎叶是黄色的，但成熟叶片却显示出绿色。有趣的是，当在弱光条件下生长时，黄金芽显示出幼芽的黄色性状性状。但一旦光照强度降低，大多数在阳光下出现的黄叶可以恢复为绿色，这也使黄金芽能够在广泛的光照条件下耐受和生存。另外，一般而言，茶树暴露于高强度的光照下，容易产生更多的黄酮类化合物。但黄金芽却相反，在高强度的光照条件下，却有更少的黄酮类化合物。
黄金芽
在之前的研究中报道了黄金芽中特定基因和化学成分 – 总多酚，总氨基酸和色素的变化。然而，关于黄金芽和其他褪绿茶植物的氮和氨基酸代谢及其调控的报道却很少。在黄化突变体植物中，已经检测到游离氨基酸含量的急剧增加和内部铵的再循环，以及蛋白质降解。先前的研究发现，与三羧酸（TCA）循环和氧化戊糖磷酸途径（OPPP）相关的基因在褪绿突变体中高度表达 – 前者用于酮戊二酸合成，后者用于提供硝酸盐同化的还原能力。因此，黄化茶树叶中氨基酸的积累可能代表受黄化影响的氮代谢全局调节的综合结果。然而，尚未阐明增加褪绿茶突变体叶中游离氨基酸含量增高的潜在分子机制。
在这篇文章中，作者结合转录组及代谢组揭示萎黄病对黄化茶叶突变体中代谢物和生物合成途径的影响，目的是揭示褪绿叶中游离氨基酸水平增加的分子机制。
作者对黄金芽进行遮光处理（60% shading of sunlight，持续10天），并取正常光照的黄金芽做对照。分析发现在黄化叶中各种游离氨基酸含量大量积累（茶氨酸，谷氨酸，谷氨酰胺和天冬氨酸分别增加了31.0％，39.8％，50.8％和62.2％），并高于正常绿叶，相关的基因也上调表达。另外，在黄化叶中检测到了较低的水平的黄酮以及大部分碳水化合物及其结合物（葡萄糖，果糖，蔗糖，山梨糖，阿拉伯糖，D-半乳糖，Dmannose，岩藻糖和果糖2,6-二磷酸）。
最后作者认为，在黄化叶中，光合作用受损，碳水化合物含量降低，葡萄糖代谢减少，黄酮含量降低，氨基酸积累增加。这表明与碳代谢相关的途径都被严重抑制，这进一步破坏了褪绿叶中碳和氮代谢之间的平衡。
黄化茶中游离氨基酸的积累可能是由于如叶绿素的生物合成减少所导致，游离氨基酸的含量随着蛋白质生物合成的消耗而降低，叶绿素和其他含氮分子的生物合成减少应导致前体代谢物的消耗减少，主要来源于谷氨酸 – 从而驱动谷氨酸在细胞中的积累。随着黄化茶叶中氮资源的积累，并且黄化茶叶中碳骨架的缺乏，氨基氮和氮资源需要更有效地储存：这可能是酰胺谷氨酰胺，茶氨酸和天冬酰胺含量增高的原因。只能在根中生物合成的L-茶氨酸可能是由于从根部连续运输和褪绿叶中消耗的降低而积累的。
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