疏水氨基酸功能
结果他们发现,天然的基因密码最经得起突变的考验。点突变常常不会影响氨基酸序列,而如果突变真的改变了氨基酸,也会由另一个物理特性相似的氨基酸来取代。据此,赫斯特与弗里兰宣称,天然的遗传密码比成千上万套随机产生的密码要优良得多。它不但不是大自然密码学家愚蠢而盲目的作品,而是万里挑一的密码系统。
天然的三联基因密码的第一个字母都有特定的对应方式。举例来说,所有以丙酮酸为前体合成的氨基酸,它们密码的第一个字母都是T。所有由α-酮戊二酸所合成的氨基酸,其三联密码第一个字母都是C;所有由草酰乙酸合成的氨基酸,第一个字母都是A;最后,几种简单前体通过单一步骤所合成的氨基酸,第一个字母都是G。
三联密码的第二个字母和氨基酸是否容易溶于水有关,或者说和氨基酸的疏水性有关。亲水性氨基酸会溶于水,疏水性氨基酸不会溶于水,但会溶在脂肪或油里,比如溶在含有脂质的细胞膜里。所有的氨基酸,可以从“非常疏水”到“非常亲水”排列成一张图谱,而正是这张图谱决定了氨基酸与第二个密码字母之间的关系。疏水性最强的六个氨基酸里有五个,第二个字母都是T,所有亲水性最强的氨基酸第二个字母都是A。介于中间的有些是G有些是C。
三联密码的第三个字母不含任何信息,不管接上哪一个字母都没关系,这组密码子都会翻译出一样的氨基酸。以甘氨酸为例,它的密码子是GGG,但是最后一个G可以代换成T、A或C。
第三个字母的随机性暗示了一些有趣的事情。二联密码可以编码16种氨基酸。如果我们从20个氨基酸里拿掉5个结构最复杂的(剩下15个氨基酸,再加上一个终止密码子)这样前两个字母与这15个氨基酸特性之间的关联就更明显了。因此,最原始的密码可能只是二联密码,后来才靠“密码子捕捉”的方式成为三联密码,也就是各氨基酸彼此竞争第三个字母。
第一个字母和氨基酸前体之间的关系直截了当,第二个字母和氨基酸的疏水性相关,第三个字母可以随机选择。这套密码系统除了可以忍受突变,还可以降低灾难发生时造成的损失,同时可以加快进化的脚步。因为如果突变不是灾难性的,那应该会带来更多的好处。
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门诊上经常有患者因为尿里有泡沫来咨询,医生基本上是先开一张尿常规化验,如果化验结果里没有蛋白、感染或红细胞,就会告诉患者基本没有问题。但是泡沫尿是怎样形成的呢?作者查阅了国际上发表的相关文献,总结如下。如果尿中泡沫比较大,排尿后泡沫迅速破裂消失,基本上是不存在疾病的,因为尿流的冲力比较大,进入尿盆后会把空气带入水肿形成泡沫。但是排尿后看到尿中有泡沫,而且泡沫大小不等,甚至有分层,就可能有问题了,基本上考虑要内科的疾病,比如说肾小球肾炎,肾病综合症等,在这些疾病中红细胞、蛋白质或氨基酸是从肾小球“漏”出来,区别于尿路出血引起的。只有大约1/3的泡沫尿当中发现有蛋白尿。从物理和化学角度来看,泡沫尿的形成有这样几个疑问,泡沫尿是怎样形成的?除了蛋白以外,其他物质会引起尿中有泡沫吗?泡沫尿的形成可能与一种叫作表面活性剂的物质有关,这种表面活性剂是一种有机化合物,具有既亲水又疏水的特点,溶于水后存在于气体与水的表面,不可溶的疏水端聚集形成气泡。肥皂能够清洁衣物,就是因为既有亲水又有疏水的这种结构。依靠亲水和输水两种活性可以将污物进行分离。啤酒中的泡沫也是由于具有亲水和疏水特点的蛋白质造成的,这主要指大麦中分离出来的脂运输蛋白。蛋白质和多肽氨基酸具有亲水和疏水活性,可以成为表面活性剂,在水中形成泡沫。另外一些游离氨基酸也具有这种特性,可以在尿中形成泡沫。经典的氨基酸尿可见于范可尼综合症,它是骨软化-肾性糖尿-氨基酸尿-高磷酸尿综合症,是遗传性或获得性近端肾小管功能异常引起的一组症候群,这些氨基酸主要是甲硫氨酸和络氨酸,这二者具有强烈的亲水和疏水特性,会从患者尿中排出。范可尼综合症患者的24小时尿中这些氨基酸的数量可以超过500毫克。在一些泌尿外科结石、肿瘤、炎症患者中血尿比较常见。当出现血尿和脓尿的时候,细胞膜破裂,释放出磷酸酯,在尿中也会形成泡沫。 虽然泡沫尿常见,但当中还是隐藏着一些疾病的,患者应该观察泡沫的大小,是不是泡沫很快就消失,有没有分层等等。最主要的还是要询问医生并作相关的检查
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